生物分类学: 生物學學科

要將生物分類，首先要知道生物與非生物的定義，但是我們似乎沒有辦法準確定義，以病毒來說，雖然可在其他生物體內寄生並複製，但在生物體外卻沒有一般生物的特徵如製造或攝取營養，生殖等現象。又如引起瘋牛病的朊粒（prion）可以造成感染卻無DNA成分，一直以來，DNA被視為生命遺傳物質，經由與RNA的轉錄轉譯過程，形成蛋白質，再進一步形成組成細胞的各個部分，如細胞膜、胞器等，而細胞則是我們長久以來所認為組成生命體的最小單位。

关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（International Code of Botanical Nomenclature，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规（英语：International Code of Nomenclature of Bacteria）》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。

传统上，生物分为五界(kingdom)，

• 原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)

Copeland提出过四界说：

• 原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界

也有人使用三域系統说。这种分类方法是依據细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。

• 古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)

另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。

• 病毒 -- 类病毒 -- 朊粒

生物分類總表

这个列表以NCBI Taxonomy （页面存档备份，存于互联网档案馆）上的分類爲基礎。

生物詳細分類表

• 古菌分類表
• 細菌分類表
• 植物分類表 (NCBI)
• 动物分类表
• 真菌分类表
• 原生生物分类表

包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。

包含放線菌、衣原體、支原體、立克次體等。

植物界

包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等。

真菌/後生動物組

真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。

動物界

即“後生動物”組。

真菌界

包括子囊菌、擔子菌、接合菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲。

其餘真核生物（原生生物和真核藻類）

真核生物除動物、植物、真菌三界之外統稱原生生物，爲併系群。

• 等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
• 放射蟲綱
• 雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
• Parabasalidea
  • 毛滴蟲綱（Trichomonada）
  • 超鞭毛綱（Hypermastigia）
• 異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
• 眼蟲門
  • 動質體目（Kinetoplastida）
  • 眼蟲綱
• 隱藻綱（Cryptophyta）
• 定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
• 不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
  • 金藻綱
  • 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae）
  • 針胞藻綱（Raphidophyceae）
  • 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes）
  • 卵菌綱
  • 褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。
  • 硅藻門
  • 黃藻門
• 囊泡蟲類
  • 頂複門，如瘧原蟲。
  • 纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。
  • 甲藻門
• 單孢子蟲門（Haplosporidia）
• 絲足蟲類
• 根腫菌類（Plasmodiophorida）
• 粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
• 葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
• 黏菌門
• 灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
• 紅藻門，如石花菜、紫菜。

註：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未歸類原生生物。

• 进化生物学、系统生物学
• 亚里士多德：《工具论》
• 林奈：双名法