Pavel Pevzner, russisch Павел Аркадьевич Певзнер, Transkription Pawel Arkadjewitsch Pewsner, (* in Kursk) ist ein russisch-US-amerikanischer Bioinformatiker.
Pevszner studierte Mathematik und Physik am Moskauer Institut für Physik und Technologie, an dem er promovierte, während er am russischen Forschungsinstitut für Genetik (NII Genetika) arbeitete. 1990 ging er an die University of Southern California in das Labor von Michael Waterman. 1992 wurde er Associate Professor an der Pennsylvania State University und 1995 Professor für Mathematik, Informatik und Molekularbiologie an der University of Southern California. 2000 wurde er Professor für Informatik an der University of California, San Diego. Dort ist er Ronald R. Taylor Professor und Direktor des NIH Center for Computational Mass Spectrometry.
Pevzner befasst sich mit Genomsequenzierung, Immunoproteogenomik, Antibiotika-Sequenzierung und vergleichender Genomik.
In der Genomsequenzierung veröffentlichte er 1989 einen Algorithmus zur Analyse von DNA-Arrays, basierend auf De-Bruijn-Folgen. 2004 führte er deren Verallgemeinerung A-Bruijn-Graphen ein. Pevzner war an verschiedenen Genomsequenzierungsprojekten beteiligt (Maus, Ratte, Huhn). Er wandte die Ergebnisse der Genomsequenzierung auch auf das Studium der Evolution von Lebewesen an, zum Beispiel in der Rekonstruktion der Genomarchitektur ausgestorbener Säuger. 2003 schlug er mit G. Tesler eine Alternative zum alten Random Breakage Model (RBM) von Genom-Rearrangements und Chromosomen-Evolution (Susumu Ohno 1971) vor, das Fragile Breakage Model (FBM). Es basiert auf dem Konzept des Breakpoint Graph und einer Häufung der Genombrüche an Schwachstellen und nicht Brüchen an zufällig gewählten Stellen. Darauf beruhen polynomiale Algorithmen für Genom-Arrangements und zugehörige Datenbanken.
Er trug ab 1999 zur Entwicklung der De-Novo-Peptidsequenzierung für die Identifikation von Proteinen bei. Pevszner erfand ein Verfahren Massenspektrometerdaten mit spektralen Netzwerken (molekularen Netzwerken) auszuwerten und wandte das 2008 auf die Entwicklung eines ersten Antikörper-Sequenzierungsverfahren an. Das wandte er in seiner Firma Digital Proteomics an. Er geht mit seinem Labor Schritte in Richtung personalisierter Immunogenomik, das heißt die Untersuchung des Antikörperspektrums einzelner Individuen für Diagnostik und Therapie.
Mit spektralen Netzwerken entwickelte er ein Verfahren der Antibiotika-Sequenzierung, das er zur Suche nach neuen Antibiotika einsetzt. Er war einer der Gründer des spektralen Netzwerks Global Natural Product Social (GNPS), dem tausende Labore angeschlossen sind.
Pevzner erhielt einen Presidential Young Investigator Award der NSF. 2010 wurde er Fellow der Association for Computing Machinery. 2011 wurde er Ehrendoktor der Simon Fraser University, er erhielt eine Professur des Howard Hughes Medical Institute und wurde 2016 Mitglied der Academia Europaea. 2018 erhielt er den Paris-Kanellakis-Preis.
Pevszner gehört zu den hochzitierten Wissenschaftlern. Er ist im Herausgebergremium von PLoS Computational Biology.
So weit nicht in den Fußnoten aufgeführt.
Einige Aufsätze:
Personendaten | |
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NAME | Pevzner, Pavel |
ALTERNATIVNAMEN | Pewsner, Pawel Arkadjewitsch; Певзнер, Павел Аркадьевич (russisch) |
KURZBESCHREIBUNG | russisch-US-amerikanischer Bioinformatiker |
GEBURTSDATUM | 20. Jahrhundert |
GEBURTSORT | Kursk |
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