Varian Beta Sars-Cov-2: Varian dari SARS-CoV-2

Varian ini termasuk varian yang dianggap penting. Ia ditemukan pertama kali di Teluk Nelson Mandela, Provinsi Eastern Cape, Afrika Selatan, pada Oktober 2020 dan dilaporkan oleh departemen kesehatan negara tersebut pada 18 Desember 2020. Analisis filogeografi menunjukkan bahwa varian ini telah muncul di daerah Teluk Nelson Mandela sejak Juli atau Agustus 2020.

Negara-negara dengan kasus terkonfirmasi varian Beta per 25 Juni 2021

Legenda:

  1.000+ kasus terkonfirmasi

  250–999 kasus terkonfirmasi

  100–249 kasus terkonfirmasi

  10–99 kasus terkonfirmasi

  2–9 kasus terkonfirmasi

  1 kasus terkonfirmasi

  Tidak ada atau tiada data

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) melabeli varian ini sebagai varian Beta bukan untuk menggantikan nama ilmiah, melainkan sebagai nama yang dipakai secara umum di ruang publik. WHO menganggapnya sebagai varian yang diwaspadai (variant of concern).

Tim genomik yang dipimpin oleh KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP) di Universitas KwaZulu-Natal menemukan varian baru ini. Varian ini ditemukan dengan pengurutan keseluruhan genom. Urutan genomik garis keturunan ini dikumpulkan ke pangkalan data urutan GISAID.

Gejala

Transmisi

Peneliti dan pihak berwenang melaporkan bahwa prevalensi varian ini lebih tinggi di antara orang muda dengan tanpa keadaan kesehatan tertentu dan sering menyebabkan penyakit serius dalam beberapa kasus dibandingkan varian lain. Departemen Kesehatan Afrika Selatan juga menyatakan bahwa varian ini mungkin menjadi mendorong gelombang kedua pandemi di negaranya karena varian ini menyebar lebih cepat daripada varian lain sebelumnya.

Genetika

 

Mutasi asam amino varian Beta SARS-CoV-2 yang dipetakan pada peta genom SARS-CoV-2 dengan sorotan pada bagian bulir

Mutasi pada SARS-CoV-2 cukup sering: lebih dari empat ribu mutasi telah dideteksi hanya pada bulir proteinnya menurut Konsorsium Britania Raya untuk Genom COVID-19.

Varian ini terdiri dari 31 mutasi: 19 mutasi tak bersinonim, 2 mutasi hapus, dan 10 mutasi bersinonim, yaitu 21 mutasi yang mengubah protein dan 10 mutasi yang tidak berdampak.

Ilmuwan mencatat bahwa varian ini bisa lebih mudah menempel pada sel manusia karena tiga mutasi dalam domain pengikat reseptor (RBD) pada bulir virus, yaitu N501Y, K417N, dan E484K. Dua di antaranya, E484K dan N501Y, ada dalam motif pengikat reseptor (RBM) dari domain pengikat reseptor (RBD). Mutasi N501Y juga ada dalam varian Alpha dan Gamma.

Perubahan asam amino E484K, sebuah mutasi domain pengikat reseptor (RBD), dilaporkan berhubungan dengan kaburnya dari antibodi penetral yang bisa berdampak buruk terhadap efikasi vaksin Covid-19 yang bergantung pada protein bulir. Mutasi bulir E484K dikaitkan dengan kasus reinfeksi dengan varian Beta di Brazil yang diyakini para peneliti sebagai kasus reinfeksi pertama untuk varian ini. Peluang perubahan dalam antigenisitas disebut sebagai "mutasi kabur" dari antibodi monoklonal yang mampu menetralkan protein bulir varian SARS-CoV-2.

Pada 23 Desember 2020, Menteri Kesehatan Britania Raya, Matt Hancock, mengumumkan bahwa dua orang yang berkunjung dari Afrika Selatan ke Britania Raya terinfeksi dengan varian Beta (varian 501.V2).

Pada 3 Mei 2021, varian ini telah masuk ke Indonesia. Per 4 Juli 2021, terdapat tujuh kasus di Indonesia yang terkena varian Beta.

• Varian SARS-CoV-2
• Varian Alpha SARS-CoV-2
• Varian Gamma SARS-CoV-2
• Varian Delta SARS-CoV-2