Adn Seachchrómasómach

Faightear an chuid is mó d' ADN i ngéanóm aonair i gcromosóim atá sa núicléas. Tá ilchineálacha ADN eischromosómach ann, agus, cé go bhfreastalaíonn cuid acu seo ar fheidhmeanna tábhachtacha bitheolaíocha, is féidir leo ról a bheith acu freisin i ngalar, mar ADNsc in ailse.

I bprócaróit, faightear ADNsc víreasach go príomha i bplasmaidí, ach, sna heocaróit tá ADNsc le fáil go príomha in orgánaidí. Is é ADN miteacoindreach príomhfhoinse den ADNsc seo in eocarótaigh. Tacaíonn an fhíric go bhfuil a hADN féin san orgánaid seo leis an hipitéis gur tháinig na miteacoindrí ó chealla baictéaracha a bhí gafa ag cealla eocarótacha sinsearachta. Is minic a úsáidtear ADN seachchrómasómach i dtaighde ar mhacasamhlú toisc go bhfuil siad éasca a aithint agus a aonrú..

Cé go bhfuil ADN seachchrómasómach ciorclach (ADNscc) le fáil i ngnáthchealla eocarótacha, is eintiteas ar leith é ADN seachchrómasómach (ADNsc) a aithníodh i núicléis na gceall ailse agus tá sé léirithe go n-iompraíonn sé go leor cóipeanna de na gníomhaí oncaigéinte.. Meastar gur príomh-fhachtóir d'aimpliúcháin géinte é ADNsc, as a dtagann go leor cóipeanna de na gníomhaí oncaigéinte agus ailsí an-ionsaitheacha.

Fuarthas amach go bhfuil ADN seachchrómasómach sa chíteaplasma difriúil ó thaobh struchtúir de agus ADN núicléach. Tá ADN cíteaplasmach níos lú meitilithe ná an ADN a fhaightear laistigh den núicléas. Deimhníodh freisin go raibh na seichimh an ADN cíteaplasmach difriúil ón ADN núicléach san orgánach céanna, rud a thaispeánann nach bloghanna d'ADN núicléach amháin iad na hADN cíteaplasmacha. I gcealla ailse, tá sé léirithe go bhfuil ecDNA aonraithe go príomha san núicléas (athbhreithnithe in).scoite go príomha leis an núicléas (athbhreithnithe in )

Chomh maith le hADn a fhaightear lasmuigh den núicléas i gcealla, soláthraíonn ionfhabhtuithe de ghéanóim víreasacha sampla d'ADN seachchrómasómach freisin.

Prócarótach

Cé nach bhfuil núicléas atá ceangailte le membrane cosúil leis na eocaryotáití ag orgánaigh phrócarótacha, tá réigiún núicléóideach iontu ina bhfaightear an príomhchrómasóim. Tá DNA eischromosómach i bprócariotáití lasmuigh den réigiún núicléóideach mar phlasmid ciorclach nó líneach. Go hiondúil is seichimh ghearra iad na plasmaidí baictéaracha, comhdhéanta de 1 chileabas (kb) go cúpla céad kb, agus tá bunús macasamhlú iontu a ligeann don plasmid macasamhlú neamhspleách ar an gcromosóim baictéarach. Tagraítear do líon iomlán plasmid ar leith laistigh de chill mar an uimhir chóip agus féadfaidh sé raon ó chomh beag le dhá chóip in aghaidh na cille go dtí an oiread agus na céadta cóip in aghaidh na cille. Déantar plasmidí baictéaracha ciorclach a aicmiú de réir na bhfeidhmeanna speisialta a sholáthraíonn na géinte atá ionchódaithe ar an plasmid. Ligeann plasmaidí torthúlachta, nó f plasmids, do chomhchuingeachadh a bheith ann ach bíonn géinte i bplasmaidí friotaíochta, nó r plasmids, a chuireann frithsheasmhacht in iúl d'éagsúlacht antaibheathaigh éagsúla ar nós ampicillin agus tetracycline. Tá plasmidanna géine ann freisin ina bhfuil na heilimintí géiniteacha atá riachtanach le go n-éireoidh baictéir phataigineacha chomh maith le plasmidí díghrádaithe a chothaíonn na géinte a ligeann do bhaictéir éagsúlacht substaintí cosúil le comhdhúile aramatacha agus seineabóitigh a dhíghrádú. Is féidir le plasmids baictéaracha feidhmiú freisin i dtáirgeadh lí, fosúchán nítrigine agus friotaíocht le miotail throma sna baictéir sin a bhfuil siad iontu.

Is féidir plasmaidí ciorclach a tharlaíonn go nádúrtha a mhodhnú chun go mbeadh ilghéinte friotaíochta agus go leor suíomhanna srianta uathúla ann, rud a fhágann gur uirlisí luachmhara iad mar veicteoirí clónála in feidhmeanna biteicneolaíochta. Tá plasmaidí ciorclach baictéaracha mar bhonn freisin le vacsaíní DNA a tháirgeadh. Déantar innealtóireacht ghéiniteach ar vacsaíní DNA plasma le géine a ionchódaíonn d’ antaigin nó do phróitéin a tháirgtear trí víreas pataigineach, baictéar nó seadáin eile. Nuair a bheidh siad seachadta isteach san óstach, spreagfaidh táirgí na ngéinte plasmid an freagra imdhíonachta dúchasach agus freagairt imdhíonachta oiriúnaitheach an óstaigh. Is minic a bhíonn na plasmids brataithe le cineál éigin aidiúvach sula seachadadh chun freagairt imdhíonachta an óstaigh a fheabhsú.

Aithníodh plasmidí baictéaracha líneacha i roinnt speiceas baictéir spirochete, lena n-áirítear baill den ghéineas Borrelia (lena mbaineann an pataigin atá freagrach as galar Lyme), roinnt speiceas de na baictéir ithreach gram-dearfach den ghéineas Streptomyces, agus sa speiceas gram-dhiúltach. Thiobacillus versutus, baictéar a ocsaídíonn sulfair. Faightear lúb bioráin nó próitéin atá nasctha go comhfhiúsach i bhfoircinn telomeric an mhóilín DNA i plasmidí líneacha na prócariotáití. Tá na lúba hairpin saibhir adenine-thymine de na baictéir Borrelia raon i méid ó 5 kilobase péirí (kb) go dtí os cionn 200 kb agus tá na géinte atá freagrach as a tháirgeadh ar ghrúpa de próitéiní dromchla móra, nó antaiginí, ar na baictéir a ligeann é chun freagairt imdhíonachta a óstaigh ionfhabhtaithe a sheachaint. Tugtar inbhéartrón ar na plasmaidí líneacha ina bhfuil próitéin atá ceangailte go comhfhiúsach le foirceann 5' na snáitheanna DNA agus is féidir leo a bheith idir 9 kb agus os cionn 600 kb ina bhfuil athrá inbhéartaithe teirminéil. D'fhéadfadh na plasmidí líneacha a bhfuil próitéin atá ceangailte go comhfhiúsach acu cuidiú le comhchuingeach baictéarach agus comhtháthú na plasmidí isteach sa ghéanóm. Is ionann na cineálacha plasmaidí líneacha seo agus an aicme is mó de DNA extrachromosomal mar ní hamháin go bhfuil siad i láthair i gcealla baictéaracha áirithe, ach glacann gach móilín DNA extrachromosomal líneach a fhaightear i gcealla eocaratacha an struchtúr inbhéartaithe seo freisin le próitéin ceangailte leis an deireadh 5 '.

D'fhéadfadh na " borganna " líneacha fada a tharlaíonn i gcomhthráth le speiceas archaeon - a d'fhéadfadh iad a óstáil agus a roinneann go leor dá gcuid géinte - a bheith ina bhfoirm anaithnid de struchtúir DNA eischromosómach.

Eocarótach

Miteacoindreach

Sna miteachondria atá i láthair i gcealla eocaryotic tá ilchóipeanna de DNA miteacoindreach dá ngairtear mtDNA atá lonnaithe laistigh den mhaitrís miteacoindreach. In ainmhithe ilcheallacha, lena n-áirítear daoine, tá 13 ghéinte sa chrómasóim mtDNA ciorclach a ionchódaíonn próitéiní atá mar chuid den slabhra iompair leictreon agus 24 ghéin a tháirgeann RNA atá riachtanach chun próitéiní miteachondrialacha a tháirgeadh; déantar na géinte seo a bhriseadh síos ina 2 ghéin rRNA agus 22 ghéin tRNA. Is é méid plasmid mtDNA ainmhí thart ar 16.6 kb agus cé go bhfuil géinte ann do shintéis tRNA agus mRNA, tá próitéiní a tháirgtear mar thoradh ar ghéinte núicléacha fós ag teastáil chun an mtDNA a mhacasamhlú nó chun próitéiní miteacoindreach a aistriú. Níl ach réigiún amháin den chrómasóim miteacoindreach nach bhfuil seicheamh códaithe ann agus is é sin an réigiún 1 kb ar a dtugtar an D-lúb a gceanglaíonn próitéiní rialála núicléacha leis. Athraíonn líon na móilíní mtDNA in aghaidh na mitochondria ó speiceas go speiceas chomh maith le idir cealla a bhfuil éilimh éagsúla fuinnimh acu. Mar shampla, tá níos mó cóipeanna de mtDNA in aghaidh na miteachondrón i gcealla matán agus ae ná mar a dhéanann fuil agus cealla craicinn. Mar gheall ar chomh gar agus atá an slabhra iompair leictreon laistigh den membrane istigh mitochondrial agus táirgeadh speiceas ocsaigin imoibríoch (ROS), agus mar gheall ar an bhfíric nach bhfuil an móilín mtDNA faoi cheangal nó faoi chosaint histones, tá an mtDNA níos mó i mbaol DNA. damáiste ná DNA núicléach. I gcásanna ina dtarlaíonn damáiste mtDNA, is féidir an DNA a dheisiú trí bhunbhealaí deisiúcháin sceite, nó scriostar an móilín mtDNA a bhfuil damáiste déanta dó (gan damáiste a dhéanamh don mhiotochondrion ós rud é go bhfuil ilchóipeanna de mtDNA per mitochondrion).

Tá an cód géiniteach caighdeánach trína n-aistrítear géinte núicléacha uilíoch, rud a chiallaíonn go bhfuil gach seicheamh 3-bhonn de chóid DNA don aimíonaigéad céanna is cuma cén speiceas as a dtagann an DNA. Mar sin féin, ní hé nádúr uilíoch an chóid seo an cás le DNA miteacoindreach a fhaightear i bhfungais, in ainmhithe, i bprótacail agus i bplandaí. Cé go ndéanann an chuid is mó de na seichimh 3-bhonn i mtDNA na n-orgánach seo códú do na aimíonaigéid chéanna leis na cinn atá sa chód géiniteach núicléach, tá roinnt seichimh mtDNA ann a chónaíonn d'aimíonaigéid atá difriúil ó na cinn dá gcomhghleacaithe DNA núicléach.

Coding differences found in the mtDNA sequences of various organisms
Cód géiniteach	Tábla aistrithe	Códón ADN bainteach leis	Códón ARN bainteach leis	Aistriú leis an gcód seo	Comparáid leis an gcód uilíoch
Cód veirteabrach miteacoindreach	2	`AGA`	`AGA`	`Ter` `(*)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Ter` `(*)`	`Arg` `(R)`
		`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Cód giostach miteacoindreach	3	`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
		`CTT`	`CUU`	`Thr` `(T)`	`Leu` `(L)`
		`CTC`	`CUC`	`Thr` `(T)`	`Leu` `(L)`
		`CTA`	`CUA`	`Thr` `(T)`	`Leu` `(L)`
		`CTG`	`CUG`	`Thr` `(T)`	`Leu` `(L)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
		`CGA`	`CGA`	`absent`	`Arg` `(R)`
		`CGC`	`CGC`	`absent`	`Arg` `(R)`
Mold, protozoan, and coelenterate mitochondrial	4 and 7	`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Invertebrate mitochondrial	5	`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Echinoderm and flatworm mitochondrial	9	`AAA`	`AAA`	`Asn` `(N)`	`Lys` `(K)`
		`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Ascidian mitochondrial	13	`AGA`	`AGA`	`Gly` `(G)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Gly` `(G)`	`Arg` `(R)`
		`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Alternative flatworm mitochondrial	14	`AAA`	`AAA`	`Asn` `(N)`	`Lys` `(K)`
		`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`TAA`	`UAA`	`Tyr` `(Y)`	`Ter` `(*)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
Chlorophycean mitochondrial	16	`TAG`	`UAG`	`Leu` `(L)`	`Ter` `(*)`
Trematode mitochondrial	21	`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`
		`ATA`	`AUA`	`Met` `(M)`	`Ile` `(I)`
		`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AAA`	`AAA`	`Asn` `(N)`	`Lys` `(K)`
Scenedesmus obliquus mitochondrial	22	`TCA`	`UCA`	`Ter` `(*)`	`Ser` `(S)`
Scenedesmus obliquus mitochondrial	22	`TAG`	`UAG`	`Leu` `(L)`	`Ter` `(*)`
Thraustochytrium mitochondrial	23	`TTA`	`UUA`	`Ter` `(*)`	`Leu` `(L)`
Pterobranchia mitochondrial	24	`AGA`	`AGA`	`Ser` `(S)`	`Arg` `(R)`
		`AGG`	`AGG`	`Lys` `(K)`	`Arg` `(R)`
		`TGA`	`UGA`	`Trp` `(W)`	`Ter` `(*)`

Airíonna bithcheimiceacha aimíonaigéid	neamhpolar	polar	bunúsach	aigéadach		Foirceannadh: stop codon

Ceaptar go bhfuil na difríochtaí códaithe mar thoradh ar mhodhnuithe ceimiceacha sna RNAanna aistrithe a idirghníomhaíonn leis na RNAnna teachtaire a tháirgtear mar thoradh ar na seichimh mtDNA a thras-scríobh.

Clóraplast

Cloroplasts eucaryotic, chomh maith leis na plastids plandaí eile, freisin go bhfuil móilíní DNA extrachromosomal. Áitíonn an chuid is mó de na clóraplasta a n-ábhar géiniteach go léir i gcrómasóim aonfháinne, ach i roinnt speiceas tá fianaise ann go bhfuil iolrach plasmid imfhálaithe níos lú. Tugann teoiric le déanaí a chuireann ceist ar an múnla caighdeánach reatha DNA clóraplasta fáinne-chruthach (cpDNA), le tuiscint go bhféadfadh cruth líneach a bheith níos coitianta ar cpDNA. Is féidir le móilín amháin de cpDNA áit ar bith ó 100-200 géinte agus athraíonn i méid ó speiceas go speiceas. Is é an méid cpDNA i bplandaí níos airde ná timpeall 120–160 kb. Na géinte a fhaightear ar an gcód cpDNA do mRNAs atá freagrach as comhpháirteanna riachtanacha den chonair fótaisintéiseach a tháirgeadh chomh maith le códú do tRNAs, rRNAs, fo-aonaid polaiméireáis RNA, agus fo-aonaid próitéin ribosómacha. Cosúil le mtDNA, níl cpDNA lán-uathrialach agus braitheann sé ar tháirgí géine núicléacha chun próitéiní clóraplasta a mhacasamhlú agus a tháirgeadh. Bíonn ilchóipeanna de cpDNA i gclóraplastaí agus is féidir leis an líon a athrú ní hamháin ó speiceas go speiceas nó ó chineál cille go cineál cille, ach freisin laistigh d'aon chill ag brath ar aois agus céim forbartha na cille. Mar shampla, tá ábhar cpDNA i gclóraplastaí cealla óga, le linn na gcéimeanna tosaigh forbartha ina bhfuil na clóraplastaí i bhfoirm próplastidí indistinct, i bhfad níos airde ná iad siúd atá i láthair nuair a aibíonn agus a leathnaíonn an chill sin, ina bhfuil plastids lánaibí.

Ciorclach

Tá DNA ciorclach eischromosómach (eccDNA) i láthair i ngach cill eocaratach, díorthaithe de ghnáth ó DNA géanómach, agus is éard atá iontu seichimh athchromasómacha DNA a fhaightear i réigiúin códaithe agus neamhchódaithe de chrómasóm. Is féidir le EccDNA a bheith éagsúil ó thaobh méide ó níos lú ná 2000 bunphéire go dtí níos mó ná 20,000 bunphéire. I bplandaí, bíonn seichimh arís agus arís eile i eccDNA cosúil leo siúd atá le fáil i réigiúin lárchriosóim na gcromosóim agus in DNA satailíte athchleachtach. In ainmhithe, tá sé léirithe go bhfuil seichimh athchleachtach i móilíní eccDNA a fheictear i DNA satailíte, DNA ribosómach 5S agus DNA telomere. Braitheann orgánaigh áirithe, amhail giosta, ar mhacasamhlú DNA crómasómach chun eccDNA a tháirgeadh ach is féidir le foirmiú eccDNA tarlú in orgánaigh eile, amhail mamaigh, go neamhspleách ar an bpróiseas macasamhlaithe. Ní dhearnadh staidéar forleathan ar fheidhm eccDNA, ach tá sé beartaithe go gcuirfeadh táirgeadh eilimintí eccDNA ó sheichimh DNA géanómacha le plaisteacht an ghéanóim eocarataigh agus go bhféadfadh tionchar a bheith aige ar chobhsaíocht an ghéanóim, ar aosú cille agus ar éabhlóid na gcromosóim.

Tá cineál ar leith DNA eischromosomal, sainithe mar ecDNA, le feiceáil go coitianta i gcealla ailse daonna. Tá géinte amháin nó níos mó ag ecDNA a fhaightear i gcealla ailse a thugann buntáiste roghnach. tá ecDNA i bhfad níos mó ná eccDNA, agus tá siad le feiceáil ag micreascópacht solais. Is gnách go mbíonn raon méide ecDNA in ailsí ó 1-3 MB agus níos faide anonn. Fuarthas móilíní móra ecDNA i núicléis na gcealla ailse daonna agus taispeántar go n-iompraíonn siad go leor cóipeanna de oncogenes tiománaithe, a thrascríobhtar i gcealla meall. Bunaithe ar an bhfianaise seo ceaptar go gcuireann ecDNA le fás ailse.

Tá uirlisí speisialaithe ann a cheadaíonn ecDNA a aithint, mar

bogearraí arna bhforbairt ag Paul Mischel agus Vineet Bafna a cheadaíonn ecDNA a aithint in íomhánna micreascópacha
"Circle-Seq, modh chun ecDNA a aonrú go fisiciúil ó chealla, aon DNA líneach atá fágtha le heinsímí a bhaint, agus an DNA ciorclach atá fágtha a sheicheamhú", arna fhorbairt ag Birgitte Regenberg agus a foireann in Ollscoil Chóbanhávan.

Víreasach

Is sampla iad DNA víreasach de DNA extrachromosomal. Tá sé ríthábhachtach géanóim víreasacha a thuiscint chun éabhlóid agus sóchán an víris a thuiscint. Ionchorpraíonn roinnt víris, mar VEID agus víris oncogenic, a DNA féin isteach i ngéanóm na cille ósta. Is féidir le géanóim víreasacha a bheith comhdhéanta de DNA aonshnáithe (ssDNA), DNA snáithe dúbailte (dsDNA) agus is féidir iad a fháil i bhfoirm líneach agus i bhfoirm chiorclach araon.

Sampla amháin d’ionfhabhtú víreas arb ionann é agus DNA eischromosómach is ea an papillomavirus daonna (HPV). Téann trí chéim ar leith den mhacasamhlú trí ghéanóim DNA HPV: bunú, cothabháil agus aimpliú. Ionfhabhtaíonn HPV cealla epithelial sa chonair anogenital agus sa chuas béil. De ghnáth, aimsítear agus glantar HPV ag an gcóras imdhíonachta. Is cuid thábhachtach de fhreagairtí imdhíonachta é DNA víreasach a aithint. Chun go mairfidh an víreas seo, ní mór an genome ciorclach a mhacasamhlú agus a fháil le hoidhreacht le linn deighilt cille.

Aithint óstchille

Is féidir le cealla DNA cíteaplasmach eachtrach a aithint. Tá impleachtaí ag baint le tuiscint a fháil ar na conairí aitheantais maidir le galair a chosc agus a chóireáil. Tá braiteoirí ag cealla ar féidir leo DNA víreasach a aithint go sonrach ar nós cosán gabhdóra cosúil le Dola (TLR).

Aithníodh Cosán na Dola, i bhfeithidí ar dtús, mar chonair a ligeann do chineálacha áirithe cille gníomhú mar bhraiteoirí atá in ann éagsúlacht de ghéanóim baictéaracha nó víreasacha agus PAMPS (patrúin mhóilíneacha a bhaineann le pataigin) a bhrath. Is eol gur gníomhaitheoirí láidre iad PAMPanna ar chomharthaíocht imdhíonachta dúchasach. Tá thart ar 10 nglacadóir cosúil le Dola (TLRanna) daonna. Aimsíonn TLRanna éagsúla sa duine PAMPS éagsúla: lipopolysaccharides ag TLR4, dsRNA víreasach ag TLR3, ssRNA víreasach ag TLR7 / TLR8, DNA víreasach nó baictéarach neamhmheitiolaithe faoi TLR9. Tháinig TLR9 chun cinn chun DNA CpG a fhaightear go coitianta i mbaictéir agus i víris a bhrath agus chun tús a chur le táirgeadh IFN (interferons de chineál I) agus cítocíní eile.

Oidhreachtúlacht

Tá difríocht idir oidhreacht DNA eischromosómach agus oidhreacht DNA núicléach a fhaightear i gcromosóim. Murab ionann agus crómasóim, níl láriméiriúin in ecDNA agus mar sin taispeánann sé patrún oidhreachta neamh-Mhindeile a chruthaíonn daonraí cealla ilchineálacha. I ndaoine, faightear beagnach an cíteaplasma ar fad ó ubh na máthar. Ar an gcúis seo, faightear DNA organelle, lena n-áirítear mtDNA, ón máthair. Beidh sócháin i mtDNA nó DNA cíteaplasmach eile le hoidhreacht ón máthair freisin. Is sampla í an oidhreacht aontuismitheora seo d’ oidhreacht neamh-Mhindelíneach. Taispeánann plandaí oidhreacht mtDNA aontuismitheora freisin. Faigheann an chuid is mó de na plandaí mtDNA ó thaobh na máthar le hoidhreacht amháin a tugadh faoi deara ná an t-adhmad dearg Sequoia sempervirens a fhaigheann mtDNA mar oidhreacht.

Tá dhá theoiric ann cén fáth a tharchuirtear an mtDNA paternal go dtí an sliocht go hannamh. Is é ceann amháin go simplí go bhfuil mtDNA paternal ag tiúchan chomh híseal sin ná an mtDNA máthar agus mar sin níl sé inbhraite sa sliocht. Baineann dara teoiric níos casta le díleá an mtDNA atharthachta chun a oidhreacht a chosc. Tá sé teoiricithe go bhféadfadh oidhreacht aontuismitheora mtDNA, a bhfuil ráta sócháin ard, a bheith ina meicníocht chun homoplasmy DNA cíteaplasmach a chothabháil.

Tábhacht chliniciúil

Uaireanta ar a dtugtar EEanna, tá baint ag eilimintí extrachromosomal, le héagobhsaíocht ghéanómach in eukaryotes. Faightear go coitianta DNAanna ildispersed beaga (spcDNAs), cineál eccDNA, i gcomhar le héagobhsaíocht ghéanóim. Díorthaítear spcDNAanna ó sheichimh athchleachtach ar nós DNA satailíte, eilimintí DNA cosúil le haisvíreas, agus eilimintí in-aistrithe sa ghéanóm. Ceaptar gur táirgí ó athshocruithe géine iad.

Go stairiúil, tagraíodh do DNA extrachromosomal (ecDNA) a fuarthas in ailse mar chrómasóm nóiméad dúbailte (DMs), a chuirtear i láthair mar chomhlachtaí crómatáin péireáilte faoi mhicreascópacht éadrom. Is ionann crómasóm dúbailte nóiméid agus ~30% de speictream ecDNA ina bhfuil ailse, lena n-áirítear coirp aonair agus fuarthas amach go bhfuil an t-ábhar céanna géine iontu agus na coirp singil. Cuimsíonn nodaireacht ecDNA gach cineál den DNA mór eischromosómach ina bhfuil oncogen a fhaightear i gcealla ailse. Feictear an cineál ecDNA seo go coitianta i gcealla ailse de chuid histeolaíochtaí éagsúla, ach ní bhíonn sé riamh i ngnáthchealla. Ceaptar go dtáirgtear ecDNA trí bhriseadh snáithe dúbailte i gcromosóim nó ró-mhacasamhlú DNA in orgánach. Léiríonn staidéir gur féidir leibhéil níos airde EEanna a thabhairt faoi deara i gcásanna ailse agus éagobhsaíocht ghéanómach eile.

Is féidir le DNA miteacoindreach ról a bheith aige maidir le tosú an ghalair ar bhealaí éagsúla. Sócháin pointe i nó socruithe malartacha géine de mtDNA a bheith nasctha le galair éagsúla a théann i bhfeidhm ar an croí, lárchóras na néaróg, córas inchríneacha, conradh gastrointestinal, súl, agus na duáin. D'fhéadfadh fo-thacar iomlán galair ar a dtugtar siondróm ídiú mitochondrial (MDDs) a bheith mar thoradh ar chailliúint an méid mtDNA atá i láthair sna mitochondria a théann i bhfeidhm ar an ae, ar an néarchóras lárnach agus imeallach, ar mhatán mín agus ar éisteacht i ndaoine. Tá torthaí measctha, agus uaireanta contrártha, i staidéir a dhéanann iarracht uimhir chóip mtDNA a nascadh leis an mbaol a bhaineann le hailse áirithe a fhorbairt. Rinneadh staidéir a thaispeánann go bhfuil baint idir leibhéil mtDNA méadaithe agus laghdaithe agus an baol méadaithe ailse chíche a fhorbairt. Tugadh faoi deara go bhfuil baint dhearfach idir leibhéil mhéadaithe mtDNA agus riosca méadaithe chun siadaí duáin a fhorbairt ach ní cosúil go bhfuil nasc idir leibhéil mtDNA agus forbairt ailse boilg.

Faightear DNA eischromosómach in Apicomplexa, ar grúpa prótasóa é. Is baill den ghrúpa Apicomplexa iad an seadán maláire (géineas Plasmodium), an pataigin a bhaineann le SEIF (Taxoplasma agus Cryptosporidium). Fuarthas DNA mitochondrial (mtDNA) sa seadán maláire. Tá dhá chineál DNA extrachromosomal le fáil sna paraisítí maláire. Is é ceann acu seo DNA líneach 6-kb agus DNA ciorclach 35-kb an dara ceann. Tá taighde déanta ar na móilíní DNA seo mar shuímh sprice féideartha núicléitíde d' antaibheathaigh.

Ról ADNsc in ailse

Tá aimpliú géine i measc na meicníochtaí is coitianta a bhaineann le gníomhachtú oncogene. Is minic a bhíonn aimplithe géine in ailse ar eilimintí extrachromosomal, ciorclach. Ceann de phríomhfheidhmeanna ecDNA in ailse is ea cur ar chumas an siadaí teacht go tapa ar líon ard cóipe, agus ag an am céanna ilchineálacht ghéiniteach gasta ollmhór cille-go-ceall a chur chun cinn. Tá na oncogenes aimplithe is coitianta in ailse le fáil ar ecDNA agus léiríodh go bhfuil siad an-dinimiciúil, ag ath-chomhtháthú i gcromosóim neamhdhúchasacha mar réigiúin staining aonchineálach (HSRanna) agus ag athrú uimhreacha cóip agus comhdhéanamh mar fhreagra ar cóireálacha éagsúla drugaí.

Tá difríocht idir cruth ciorclach ecDNA agus struchtúr líneach DNA crómasómach ar bhealaí brí a mbíonn tionchar acu ar phataigineas ailse. Tá aschur tras-scríobhach ollmhór ag oncogenes atá ionchódaithe ar ecDNA, rangaithe sa 1% is fearr de ghéinte sa tras-scríbhinn iomlán . I gcodarsnacht le plasmids baictéarach nó DNA mitochondrial, tá ecDNA chromatinized, ina bhfuil leibhéil arda de marcanna histone gníomhach, ach gann de marcanna histone repressive. Níl an dhlúthú ardoird atá i láthair ar DNA crómasómach ar an ailtireacht chromatin ecDNA agus tá sé ar cheann de na DNA is inrochtana sa ghéanóim ailse ar fad.

D’fhéadfaí EcDNAanna a chnuasach le chéile laistigh den núicléas, ar féidir moil ecDNA a thabhairt orthu. Go spásúil, d’fhéadfadh moil ecDNA a bheith ina gcúis le hidirghníomhaíochtaí idirmhóilíneacha feabhsaitheoir-géine chun ró-eisiúint oncogene a chur chun cinn.

Naisc sheachtracha

https://www.theguardian.com/science/2023/feb/18/bond-villain-dna-could-transform-cancer-treatment-scientists-say Bond villain’ DNA could transform cancer treatment, scientists say]

Tagairtí

This article uses material from the Wikipedia Gaeilge article ADN seachchrómasómach, which is released under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 license ("CC BY-SA 3.0"); additional terms may apply (view authors). Content is available under CC BY-SA 4.0 unless otherwise noted. Images, videos and audio are available under their respective licenses.
®Wikipedia is a registered trademark of the Wiki Foundation, Inc. Wiki Gaeilge (DUHOCTRUNGQUOC.VN) is an independent company and has no affiliation with Wiki Foundation.