Aktinobaktérie

Actinobacteria, Actinobacteriota, Actinobacteraeota, Actinomycetota; staršie: aktinomycéty a príbuzné organizmy) sú kmeň baktérií. Väčšinou sú grampozitívne. Môžu byť suchozemské alebo vodné. Do kmeňa aktinobaktérie patria napríklad aktinomycéty (Actinomycetales).

Aktinobaktérie
Actinomyces israelii
Vedecká klasifikácia
Doména baktérie (Bacteria) Ríša (regnum) baktérie (Bacteria) Kmeň (phylum) aktinobaktérie (Actinobacteria)
Vedecký názov
Actinobacteria Goodfellow, 2012
Synonymá
Zoznam "Actinobacteria" Goodfellow 2012 "Actinobacteraeota" Oren et al. 2015 "Actinobacteriota" Whitman et al. 2018 "Actinobacteria" Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997 "Actinobacteria" (ex Margulis 1974) Cavalier-Smith 2020
Vedecká klasifikácia prevažne podľa tohto článku

Actinobacteria je v niektorých systémoch aj názov jednej z tried kmeňa aktinobaktérie, ktorá sa inde volá Actinomycetia - pozri v kapitole Systematika.

V niektorých starších systémoch kmeň Actinobacteria zahŕňal len jednu triedu Actinobacteria - pozri v kapitole Systematika.

Pre ľudí majú aktinobaktérie veľký hospodársky význam, pretože poľnohospodárstvo a lesníctvo sú závislé od ich úlohy v pôdnom systéme. V pôde pomáhajú rozkladať organické látky mŕtvych organizmov, takže molekuly môžu byť znovu prijímané rastlinami. Zatiaľ čo túto úlohu zohrávajú aj huby, aktinobaktérie sú oveľa menšie a pravdepodobne nezaberajú rovnakú ekologickú niku. V tejto úlohe kolónie baktérií často vytvárajú rozsiahle pseudomycélium, podobne ako huby (mycélium), a názov dôležitého radu aktinomycéty, odráža skutočnosť, že sa dlho predpokladalo, že ide o huby. Niektoré pôdne aktinobaktérie (napr. rod Frankia) žijú symbioticky na koreňoch rastlín v pôde, fixujú pre rastliny dusík výmenou za prístup k niektorým rastlinným sacharidom. Iné druhy, ako napríklad mnoho druhov rodu Mycobacterium, sú dôležitými patogénmi.

Okrem ich významu v pôde, nie sú aktinobaktérii veľmi preskúmané. Hoci sa v súčasnosti chápu predovšetkým ako pôdne baktérie, môžu byť hojnejšie v sladkých vodách. Aktinobaktérie sú jedným z dominantných kmeňov baktérií a obsahujú jeden z najpočetnejších bakteriálnych rodov, Streptomyces. Streptomyces a iné aktinobaktérie sú hlavnými prispievateľmi k biologickému pufrovaniu pôdy (udržiavajú konštantné pH). Sú tiež zdrojom mnohých antibiotík (β-laktámy, tetracyklíny, makrolidy, aminoglykosidy alebo glykopeptidy).

Rod Bifidobacterium je najbežnejšou baktériou v mikrobióme ľudských dojčiat. Hoci dospelí majú menej bifidobaktérií, črevné bifidobaktérie pomáhajú udržiavať črevný epitel a redukujú lipopolysacharidy v čreve.

Hoci niektoré z najväčších a najkomplexnejších bakteriálnych buniek patria medzi aktinobaktérie, skupina morských aktinobaktérii bola opísaná ako najmenšie voľne žijúce bunky.

O niektorých sibírskych alebo antarktických aktinobaktériách sa hovorí, že sú najstarším žijúcim organizmom na Zemi, ktorý zamrzol v permafroste asi pred pol miliónom rokov. Symptómy života boli detegované uvoľňovaním oxidu uhličitého zo vzoriek permafrostu starého do 640 tisíc rokov.

kmeň aktinobaktérie (Actinobacteria/ Actinobacteriota/ Actinomycetota) [=staršie: trieda Actinobacteria v širšom zmysle]:

• (bez mena)
  • trieda Rubrobacteria [=staršie: podtrieda Rubrobacteridae]
  • trieda Thermoleophilia - Poznámka: Staršie sa obsah tejto triedy zaraďoval do triedy Rubrobacteria
  • (bez mena)
    • trieda Acidimicrobiia [=staršie: podtrieda Acidimicrobidae]
    • (bez mena)
      • trieda Actinomycetia [=trieda Actinobacteria v užšom zmysle; =staršie: podtrieda Actinobacteridae] - Poznámky: 1. Sem patrí okrem iného rad aktinomycéty (Actinomycetales; vrátane bývalého radu Bifidobacterales) a rad Mycobacteriales (t.j. najmä rod mykobaktéria - Mycobacterium). 2. Od triedy Actinomycetia sa v období po roku 2012 niektoré rady vydeľovali do samostatnej sesterskej triedy Nitriliruptoria
      • trieda UBA4738
• (bez mena)
  • trieda Coriobacteriia [=staršie: podtrieda Coriobacteridae]
  • trieda UBA9087
  • trieda UBA1414
  • trieda RBG-13-55-18

Ako vidno, kým dnes sa obyčajne kmeň Actinobacteria delí na triedy, v niektorých starších systémoch (Bergey's Manual 2004) zahŕňal tento kmeň len jednu triedu Actinobacteria, ktorá sa ďalej delila na podtriedy (zodpovedajúce dnešným triedam), prípadne priamo na rady - porov. aj systematiku uvedenú v dolnej časti článku baktérie.

Staršie sa do kmeňa aktinobaktérie zaraďoval aj rod Sphaerobacter (ako samostatná monotypická podtrieda Sphaerobacteridae), ktorý bol v roku 2004 preradený do susedstva rodu Thermomicrobium (dnes zaraďovaného do kmeňa Chloroflexota).

Zdroje tejto kapitoly: