A fauna da Nova Guiné compreende um largo número de mamíferos, répteis, aves, peixes, invertebrados e anfíbios.
Como é a maior ilha tropical do mundo, ocupando 0,5% da superfície terrestre mundial, ainda suporta uma elevada percentagem da biodiversidade global. Cerca de 4 642 espécies de vertebrados habitam a ilha de Nova Guiné e as suas águas circundantes, que constituí 8% dos vertebrados mundiais reconhecidos. Isto engloba 4% dos lagartos e dos mamíferos do mundo, sendo 10% dos peixes do mundo.
O número de espécies globais e espécies de invertebrados da Nova Guiné são pouco conhecidas e, por isso, uma comparação exata é difícil. As borboletas são o maior grupo de invertebrados conhecidos e só nesta ilha encontram-se 735 espécies delas, o que corresponde a 4,2% do total mundial, que por sua vez tem 17 500 espécies de borboletas.
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