Rfam
Rfam je baza podataka koja sadrži informacije o familijama nekodirajućih RNK (ncRNK) i drugih strukturnih RNK elemenata.
Ona je anotirana baza podataka otvorenog pristupa koju je originalno razvio Wellcome Trust Sanger Institute u kolaboraciji sa Janelia Farm, i koju trenutno održava Evropski bioinformatički institut. Rfam je dizajnirana na sličan način sa Pfam bazom podataka za anotaciju proteinskih familija.
| Kontent | |
|---|---|
| Opis | Rfam baza podataka sadrži modele poravnanja, konsenzusnih sekundarnnih struktura i kovarijansi RNK familija. |
| Tipovi podataka | RNK familije |
| Organizam | svi |
| Kontakt | |
| Istraživački centar | EBI |
| Primarni citat | PMID 23125362 |
| Pristup | |
| Format podataka | Stokholmski format |
| Veb stranica | Rfam |
| URL za preuzimanje | Rfam ftp |
| Alati | |
| Razno | |
| Licenca | Javno vlasništvo |
| Obeležavajuća etiketa | yes |
Za razliku od proteina, ncRNK sekvence često imaju slične sekundarne strukture, mada njihove primarne strukture nisu slične. Rfam deli ncRNK sekvence u familije na bazi evolucije iz zajedničlig pretka. Poravnavanja višestrukih sekvenci (MSA) tih familija može da pruži uvid u njihovou strukturu i funkciju, kao što je to slučaj sa proteinskim familijama. MSA su postale još korisnije dodatkom sekundarne strukture. Rfam istraživači takođe doprinose vikipedijinoj inicijativi: RNA WikiProject.
Reference
Spoljašnje veze
This article uses material from the Wikipedia Српски / Srpski article Rfam, which is released under the Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 license ("CC BY-SA 3.0"); additional terms may apply (view authors). Садржај је доступан под лиценцом CC BY-SA 4.0 осим ако је другачије наведено. Images, videos and audio are available under their respective licenses.
®Wikipedia is a registered trademark of the Wiki Foundation, Inc. Wiki Српски / Srpski (DUHOCTRUNGQUOC.VN) is an independent company and has no affiliation with Wiki Foundation.