Orthornavirae

Orthornavirae
Im Zentrum: Phylogenetischer Baum
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Riboviria Reich: Orthornavirae
Taxonomische Merkmale
Genom: RNA Baltimore: Gruppen 3, 4, 5
Wissenschaftlicher Name
Orthornavirae
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NCBI Taxonomy: 2732396 NCBI Reference: 2732396 ICTV Taxon History: 201907198

Das Reich Orthornavirae umfasst alle Viren, die ein RNA-Genom haben und eine RNA-abhängige RNA-Polymerase (RdRp) kodieren. Das Reich umfasst dsRNA-, (+)ssRNA- und (-)ssRNA-Viren des Realm Riboviria, der fast alle RNA-Viren enthält. Dies entspricht den Gruppen 3, 4 respektive 5 der überkommenen Baltimore-Klassifikation. Der Name des Taxons ist abgeleitet von griechisch ὀρθός Orthos, deutsch ‚gerade‘ sowie RNA für die Art des Genoms und dem Suffix -virae für ein Reich von Viren.

Das Reich Orthornavirae beinhaltet derzeit (28. September 2023) folgende Mitglieder:

Reich Orthornavirae

• Phylum Duplornaviricota
  • Klasse Chrymotiviricetes mit einziger Ordnung Ghabrivirales. Darin:
    • Familie Chrysoviridae
    • Familie Megabirnaviridae
    • Familie Quadriviridae
    • Familie Totiviridae
  • Klasse Resentoviricetes mit einziger Ordnung Reovirales. Darin:
    • Familie Sedoreoviridae
    • Familie Spinareoviridae
  • Klasse Vidaverviricetes mit einziger Ordnung Mindivirales. Darin:
    • Familie Cystoviridae
• Phylum Kitrinoviricota
• Klasse Alsuviricetes
• Ordnung Hepelivirales u. a. mit Familie Hepeviridae
• Ordnung Martellivirales
• Ordnung Tymovirales
• Klasse Flasuviricetes mit einziger Ordnung Amarillovirales, diese mit einziger Familie Flaviviridae
• Klasse Magsaviricetes mit einziger Ordnung Nodamuvirales. Darin:
• Familie Nodaviridae
• Familie Sinhaliviridae
• Klasse Tolucaviricetes mit einziger Ordnung Tolivirales. Darin:
• Familie Carmotetraviridae
• Familie Tombusviridae
Die vorgeschlagene Spezies „Spodoptera-litura-Männchen-tötendes Virus“ („Spodoptera litura male-killing virus“, SlMKV oder SLMKV) ist nach den Autoren Nagamine et al. (2023) nahe verwandt mit der Ordnung Tolivirales und könnte daher ebenfalls der Klasse Tolucaviricetes angehören, auch wenn sie in der Taxonomie des NCBI als „unclassified Riboviria“ geführt wird.
• Phylum Lenarviricota u. a. mit den Phagen MS2 und Qβ
• Phylum Negarnaviricota u. a. mit den Influenzaviren
• Phylum Pisuviricota
  • Klasse Duplopiviricetes mit einziger Ordnung Durnavirales. Darin:
    • Familie Amalgaviridae
    • Familie Curvulaviridae
    • Familie Fusariviridae
    • Familie Hypoviridae
    • Familie Partitiviridae mit vorgeschlagenen Spezies „Drosophila biauraria male killing partitivirus 1“ (DbMKPV1) und den „Osugoroshi-Viren“ (OGVs, „Homona magnanima male killing viruses“)
    • Familie Picobirnaviridae
  • Klasse Pisoniviricetes
    • Ordnung Nidovirales u. a. mit Familie Coronaviridae
    • Ordnung Picornavirales
    • Ordnung Sobelivirales u. a. mit Familie Barnaviridae
  • Klasse Stelpaviricetes
    • Ordnung Patatavirales mit Familie Potyviridae
    • Ordnung Stellavirales mit Familie Astroviridae
  • Ohne Zuordnung zu einer Klasse:
    • Ordnung Yadokarivirales mit Familie Yadokariviridae
  • ohne Zuordnung zu einer Klasse oder Ordnung:
    • Familie Hadakaviridae
• Phylum „Arctiviricota“ (Vorschlag)
• Phylum „Paraxenoviricota“ (Vorschlag)
• Phylum „Pomiviricota“ (Vorschlag)
• Phylum „Taraviricota“ (Vorschlag) (benannt nach dem Tara Oceans Consortium)
  • Klade „Quenyaviren“ (englisch „quenyaviruses“, Vorschlag)
    Spezies „Kwi-Virus“, „Nai-Virus“, „Nete-Virus“ und „Sina-Virus“ (Vorschläge)
• Phylum „Wamoviricota“ (Vorschlag)
• ohne Zuordnung zu einem Phylum oder einer Klasse (Incertae sedis):
  • Familie Birnaviridae
  • Familie Permutotetraviridae
  • ohne Zuordnung zu einer Familie:
    • Gattung Botybirnavirus

Die fünf im April 2022 vorgeschlagenen Phyla umfassen etwa 5.500 Kandidatenspezies.

Vereinfachtes Kladogramm nach Wolf et al. (2018):

Eine detaillierte Darstellung ist in der folgenden Grafik gegeben:

 

Es wird vermutet, dass die RNA-Viren der Orthornavirae bereits in der RNA-Welt oder in Protobionten vor dem Urvorfahr aller heutigen zellulären Organismen (Bakterien sowie Archaeen und Eukaryoten) entstanden. Den Lenarviricota fehlen nämlich die Kapside – mit Ausnahme einiger Leviviren (Ordnung Levivirales). Zudem haben diese im Vergleich zu den anderen Viren der Orthornavirae die am stärksten divergierenden Proteine, so dass sie der Ursprung der meisten mobilen genetischen Elemente (MGEs) sein könnten, die bei zellulären Organismen und DNA-Viren zu finden sind. Die meisten Prokaryoten infizierenden RNA-Viren (RNA-Phagen) könnten innerhalb der Jahrmillionen ausgestorben sein oder auf Eukaryoten übergesprungen sein, wo sie gute Bedingungen für ihre Replikation vorfanden, etwa im Vorhandensein des eukaryotischen Cytosols. Umgekehrt hatten Prokaryoten in dieser Zeit Abwehrmechanismen (wie CRISPR) entwickelt, die es den meisten RNA-Viren unmöglich machen, sich in ihnen zu replizieren.

• Nuruddin Unchwaniwala, Hong Zhan, Janice Pennington, Mark Horswill, Johan A. den Boon, Paul Ahlquist: Subdomain cryo-EM structure of nodaviral replication protein A crown complex provides mechanistic insights into RNA genome replication. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 20. Juli 2020, doi:10.1073/pnas.2006165117, PMID 32690711 (englisch, pnas.org [PDF]). 

• Advanced Cryo-EM Reveals Viral RNA Replication Complex Structure in “Game-Changing” Detail, auf: SciTechDaily vom 2. August 2020, Quelle: Morgridge Institute for Research (englisch).